Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCAP28676 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCAP28676 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCAP28676 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCAP28676 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCAP28676 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCAP28676 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GCAP28676 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCAP28676 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCAP28676 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCAP28676 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCAP28676 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCAP28676 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCAP28676 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCAP28676 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCAP28676 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms