Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms