Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD247P20963 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD247P20963 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD247P20963 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD247P20963 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD247P20963 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD247P20963 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD247P20963 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD247P20963 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms