Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASTP20810 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASTP20810 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CASTP20810 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASTP20810 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASTP20810 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASTP20810 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASTP20810 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASTP20810 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CASTP20810 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASTP20810 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASTP20810 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASTP20810 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASTP20810 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASTP20810 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASTP20810 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CASTP20810 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms