Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms