Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms