Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGCP20142 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGCP20142 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGCP20142 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGCP20142 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGCP20142 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGCP20142 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGCP20142 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGCP20142 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGCP20142 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGCP20142 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGCP20142 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGCP20142 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms