Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms