Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT4P19013 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT4P19013 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT4P19013 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT4P19013 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT4P19013 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT4P19013 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT4P19013 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms