Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF3P18847 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF3P18847 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF3P18847 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF3P18847 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF3P18847 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF3P18847 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF3P18847 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms