Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB9P17482 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms