Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD44P16070 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD44P16070 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD44P16070 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD44P16070 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD44P16070 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD44P16070 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD44P16070 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms