Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF4P15884 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF4P15884 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF4P15884 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF4P15884 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF4P15884 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms