Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT13P13646 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT13P13646 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT13P13646 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT13P13646 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT13P13646 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT13P13646 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT13P13646 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT13P13646 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT13P13646 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT13P13646 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT13P13646 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT13P13646 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT13P13646 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT13P13646 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms