Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARGP13631 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARGP13631 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARGP13631 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARGP13631 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARGP13631 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARGP13631 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARGP13631 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARGP13631 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARGP13631 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARGP13631 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARGP13631 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RARGP13631 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RARGP13631 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARGP13631 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARGP13631 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms