Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2AP11388 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms