Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1P11387 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1P11387 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1P11387 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1P11387 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1P11387 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1P11387 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1P11387 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1P11387 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms