Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRM1P11229 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM1P11229 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms