Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

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Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
LAMC1P11047 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LAMC1P11047 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
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