Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI3P10071 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI3P10071 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI3P10071 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI3P10071 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI3P10071 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI3P10071 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI3P10071 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI3P10071 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI3P10071 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI3P10071 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI3P10071 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI3P10071 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI3P10071 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI3P10071 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI3P10071 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI3P10071 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GLI3P10071 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms