Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNHG28P0DPA3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNHG28P0DPA3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms