Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC166P0CW27 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms