Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC172P0C7W6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC172P0C7W6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms