Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L7P0C7H9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L7P0C7H9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms