Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB5P09067 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms