Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP3P08254 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP3P08254 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP3P08254 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP3P08254 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP3P08254 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP3P08254 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP3P08254 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP3P08254 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP3P08254 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP3P08254 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP3P08254 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP3P08254 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP3P08254 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP3P08254 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms