Protein–RNA interactions for Protein: P05496

ATP5G1, ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G1P05496 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5G1P05496 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5G1P05496 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5G1P05496 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5G1P05496 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5G1P05496 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5G1P05496 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms