Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDN1P05305 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDN1P05305 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDN1P05305 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDN1P05305 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDN1P05305 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDN1P05305 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDN1P05305 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDN1P05305 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDN1P05305 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDN1P05305 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDN1P05305 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDN1P05305 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDN1P05305 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDN1P05305 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDN1P05305 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDN1P05305 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDN1P05305 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDN1P05305 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDN1P05305 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDN1P05305 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDN1P05305 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDN1P05305 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms