Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYBBP04839 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYBBP04839 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYBBP04839 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYBBP04839 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYBBP04839 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms