Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOEP02649 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOEP02649 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOEP02649 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOEP02649 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOEP02649 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOEP02649 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOEP02649 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APOEP02649 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms