Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNAP02545 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNAP02545 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMNAP02545 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMNAP02545 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNAP02545 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNAP02545 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNAP02545 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNAP02545 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms