Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms