Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAMP5O95183 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP5O95183 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms