Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms