Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA3O75145 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms