Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG13O75143 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG13O75143 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG13O75143 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG13O75143 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG13O75143 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG13O75143 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG13O75143 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms