Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LY75O60449 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LY75O60449 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LY75O60449 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LY75O60449 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LY75O60449 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LY75O60449 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LY75O60449 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LY75O60449 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LY75O60449 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LY75O60449 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LY75O60449 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LY75O60449 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LY75O60449 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LY75O60449 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LY75O60449 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LY75O60449 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LY75O60449 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms