Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA5O60264 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms