Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX6O43752 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX6O43752 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX6O43752 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX6O43752 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX6O43752 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX6O43752 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX6O43752 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX6O43752 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms