Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYTH3O43739 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms