Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASA4O43374 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASA4O43374 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASA4O43374 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASA4O43374 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RASA4O43374 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RASA4O43374 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASA4O43374 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RASA4O43374 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASA4O43374 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms