Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC7A4O43246 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms