Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRXO43186 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRXO43186 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRXO43186 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRXO43186 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRXO43186 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRXO43186 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRXO43186 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRXO43186 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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