Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP26A1O43174 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP26A1O43174 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP26A1O43174 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms