Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms