Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR1CO15160 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms