Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARPC1BO15143 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms