Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA3EO15041 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms