Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCYO14598 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCYO14598 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCYO14598 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCYO14598 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCYO14598 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VCYO14598 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VCYO14598 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VCYO14598 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms