Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms